GloBIAS

Projekttitel: Global Society of BioImage Analysts (GloBIAS)

Projektdauer: 2023 – 2025

Forschungsbereich: Biowissenschaften und Medizin

In den letzten Jahren hat sich die Berufsbezeichnung „BioImage Analyst“ durch die Aktivitäten des Netzwerks der BioImage-Analysten (NEUBIAS) etabliert. Unser Ziel ist es, die erfolgreiche Arbeit von NEUBIAS fortzusetzen und daraus eine globale Vereinigung zu machen: die Global Society of BioImage Analysts (GloBIAS).

Ziele

Ein Bioimage-Analyst ist ein Experte auf dem Gebiet der Bildwissenschaft, der Biowissenschaften und Informatik miteinander verbindet und über Fachkenntnisse in der Nutzung von Rechenleistung zur Analyse von Biobilddaten verfügt. In der Tradition des Netzwerks europäischer Bioimage-Analysten (NEUBIAS) wollen wir Wissen über modernste Werkzeuge und Methoden der Biobildanalyse verbreiten und unsere Aktivitäten auf eine langfristigere Ebene heben.

Ausblick

Während der Projektlaufzeit planen wir, 1) GloBIAS offiziell als Verein zu gründen, 2) Workshops für Biobildanalysten zu organisieren und 3) Datenbanken und Publikationen zu Schulungen und bewährten Verfahren in der Biobildanalyse aufzubauen.

Publikationen

• A Survey on Bioimage Analysis Needs, 2015 https://zenodo.org/records/4648077
• A Hitchhiker’s guide through the bio-image analysis software universe https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/1873-3468.14451
• Challenges and opportunities for bioimage analysis core-facilities https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jmi.13192
• https://gerbi-gmb.de/2023/01/24/neubias_czi_funding/

Team

Teamleitung

• Dr. Robert Haase

Partner

• Dr. Kota Miura (Zentrum für Zellbildgebung – Core Facilities, Universität Göteborg, Schweden)
• Dr. Christian Tischer (Data Science Center, EMBL Heidelberg, Deutschland)
• Dr. Florian Levet (Bordeaux Imaging Center, Bordeaux, Frankreich)
• Dr. Paula Sampaio (i3S – Instituto de Investigação e Inovação em Saúde, Universität Porto, Portugal)
• Prof. Clara Prats (Universität Kopenhagen und die nationale BioImaging-Infrastruktur „BioImaging Core Facility“, Dänemark)
• Dr. Julia Fernandez-Rodriguez (Sahlgrenska-Akademie, Zentrum für Zellbildgebung – eine nationale Kernanlage, Universität Göteborg, Schweden)
• Rocco D’Antuono (The Francis Crick Institute, London, Großbritannien)
• Dr. Simon F. Nørrelykke (Harvard Medical School, USA)
• Elnaz Fazeli (Universität Helsinki)
• Dr. Beth Cimini (Broad Institute, Boston, USA)
• Dr. Christa Walter (German BioImaging, Deutschland)