NFDI4BioImage

Projekttitel: NFDI4BioImage

Projektdauer: 2023 – 2028

Forschungsbereich: Biowissenschaft und Medizin

NFDI4BIOIMAGE it ein Konsortium der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) in Deutschland. Unser Schwerpunkt liegt auf allen Schritten des Lebenszyklus von Forschungsdaten im Bereich der Mikroskopie und der Biobildanalyse.

Ziele

NFDI4BIOIMAGE hat sich zum Ziel gesetzt, Wissenschaftlern aus allen naturwissenschaftlichen und biomedizinischen Forschungsbereichen praktikable und vertrauenswürdige Lösungen für den Umgang mit der stetig wachsenden Menge an Biobilddaten aus den verschiedenen (Licht-)Mikroskopieverfahren und den damit verbundenen biophotonischen Technologien bereitzustellen. Biobilddaten sollten daher den FAIR-Prinzipien entsprechen, d. h. auffindbar (Findable), zugänglich (Accessible), interoperabel (Interoperable) und wiederverwendbar (Re-Usable) sein. Die Verbesserung der Zugänglichkeit und Wiederverwendbarkeit von Daten fördert die Biobildinformatik, jene wissenschaftliche Disziplin, die sich der quantitativen Analyse und der softwaregestützten Wissensgewinnung aus Biobilddaten widmet.

Ausblick

Am ScaDS.AI Dresden/Leipzig und an der Universität Leipzig werden wir uns auf die Koordination von Schulungsmaßnahmen und die Einbindung der Community innerhalb von NFDI4BioImage konzentrieren. Wir bauen eine Datenbank mit Schulungsmaterialien auf und organisieren Kurse, um Wissen über bewährte Verfahren im Forschungsdatenmanagement für mikroskopische Bilddaten zu verbreiten.

Publikationen

• Research data management for bioimaging: the 2021 NFDI4BIOIMAGE community survey https://f1000research.com/articles/11-638v
• NFDI4BIOIMAGE – An Initiative for a National Research Data Infrastructure for Microscopy Data https://archiv.ub.uni-heidelberg.de/volltextserver/29489/

Team

Teamleitung

• Stefanie Weidtkamp-Peters (HHU Düsseldorf)

Teammitglieder bei ScaDS.AI

• Lea Kabjesz (Leipzig University)
• Lea Gihlein (Leipzig University)
• Mara Harriet Lampert (TU Dresden)
• Robert Haase (Leipzig University)

Partner

• Prof. Stefanie Weidtkamp-Peters (Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf und German BioImaging – Gesellschaft für Mikroskopie und Bildanalyse e.V. )
• Björn Grüning (Albert Ludwigs-Universität Freiburg)
• Anna Kreshuk (Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie)
• Elisa May (Deutsches Krebsforschungszentrum)
• Jan-Philipp Mallm (Deutsches Krebsforschungszentrum)
• Marc-Thilo Figge (Leibniz-Institut für Naturstoffforschung und Infektionsbiologie)
• Werner Zuschratter (Leibniz-Institut für Neurobiologie)
• Thomas Zobel (Westfälische Wilhelms-Universität Münster)
• Markus Blank-Burian (Westfälische Wilhelms-Universität Münster)
• Susanne Kunis (Universität Osnabrück)