Verwaltung und Verarbeitung von Massenspektrometerdaten
Type of thesis: Masterarbeit / location: Leipzig / Status of thesis: Finished theses
Am Helmholtz Zentrum für Umweltforschung (UFZ) werden Wechselwirkungen zwischen Mensch und Natur erforscht. Ein Schwerpunkt ist dabei der Verbleib von Chemikalien in der Umwelt und deren Einfluss auf Mensch und Ökosystem. Ein chemischer Stoff tritt jedoch nie isoliert in der Umwelt auf, sondern mischt sich mit einem Hintergrund aus natürlich vorkommenden chemischen Substanzen. Dieses natürliche organische Material stellt eine der komplexesten Mischungen von chemischen Substanzen dar, und ist praktisch überall auf der Erde zu finden.
Am UFZ werden Spitzentechnologien angewandt, um die natürlich vorkommenden Substanzen mit größtmöglicher Genauigkeit zu untersuchen, unter anderem mit sogenannter ultrahochauflösender Massenspektrometrie. Zehntausende Moleküle können so in jeder Probe detektiert und chemische Summenformeln aus der Kenntnis von exakten Atommassen und gemessener Masse berechnet werden. Die so anfallenden Datensätze sind sehr groß, haben eine komplexe Struktur und sind durch chemische Regeln und Probenherkunft mit- und untereinander verknüpft.
In einem Gemeinschaftsprojekt von ScaDS und UFZ wollen wir eine Datenmanagement- und Datenevaluationsplattform entwickeln, die den hohen Anforderungen an die großen und komplexen Datensätze gerecht wird. Wir bieten dazu verschiedene Themen für Masterarbeiten zur Entwicklung einer Datenmangementmentarchitektur basierend auf Big Data Technologien (Hadoop, Spark, Flink) zur Datenvisualisierung und zur Entwicklung von Auswertungsalgorithmen.
Wir suchen Interessierte Studenten mit
- Motivation zur Arbeit in einem interdisziplinären Projekt
- Erfahrungen im Datenmanagement
- Gute Programmierfähigkeiten (Java or Scala or Python)
- Erfahrung mit Apache Hadoop/Spark/Flink wäre willkommen, aber keine Voraussetzung
- Tiefes Wissen in der Chemie ist keine Voraussetzung
Kontakt: